El proceso de adscripción regula la reserva de plaza en un Instituto de Educación Secundaria para 1.º ESO del alumnado de 6.º curso de Educación Primaria procedente de los centros adscritos, así como de alumnado de 4.º ESO de Centros Públicos Integrados.
Los centros de Educación Primaria adscritos al IES Virgen del Pilar son:
- CEIP Jerónimo Blancas y Tomás, de Zaragoza
- CEIP Montecanal, de Zaragoza
- CEIP Valdespartera, de Zaragoza
- CEIP Margarita Salas, de Zaragoza
- CEIP Doctor Azúa, de Zaragoza
- CEIP César Augusto, de Zaragoza
- CEIP Césareo Alierta, de Zaragoza
- CRA Orba, de Jaulín y Botorrita
- CEIP Castillo Qadrit, de Cadrete
Los centros de Educación Secundaria adscritos al IES Virgen del Pilar son:
- CPI Val de la Atalaya, de María de Huerva
- IES María Moliner, de Zaragoza
- CPI Castillo Qadrit, de Cadrete
- CPI San Jorge, de Zaragoza
- CPI Parque Venecia, de Zaragoza
- CPI Arcosur, de Zaragoza
- CPI Zaragoza Sur, de Zaragoza
